Генетическая характеристика крупного рогатого скота разных пород Западной Сибири по STR-маркерам

Использование микросателлитного анализа в контроле достоверности происхождения молодняка позволило создать обширную информационную базу генетических маркеров крупного рогатого скота, которую успешно можно использовать для контроля селекционных процессов в породах и отдельных стадах. Цель исследований заключалась в изучении генетического разнообразия 7 пород крупного рогатого скота молочного и мясного направлений продуктивности, их филогенетического родства, межпородной и внутрипородной дифференциации, генетического разнообразия, гомо-гетерозиготности, инбридинга и других популяционно-генетических параметров. Генотипирование животных проведено набором реагентов «GeneProfile Cattle», предназначенным для генетической идентификации и определения родства крупного рогатого скота (Bos тaurus), по 16 локусам микросателлитов. На примере одного локуса TGLA53 показаны породная специфичность частот аллелей и определенные различия. Аллели 174, 178, 182, 186, 188, 190 во всех породах встречаются крайне редко или не выявлены. Напротив, аллели 160,162, 172 встречаются от 28,8 до 44,4%. Приватных аллелей в голштинской породе выявлено 13, в симментальской и герефордской породах – по 1 аллелю, в красно-пестрой – 2. Количество аллелей на локус в голштинской породе – 12, красно-пестрой голштинской – 9,75, красной степной – 8,94, герефордской – 10,25, галловейской – 8,44, в казахской белоголовой породе – 5,69. Число эффективных аллелей варьирует от 3,59 (казахская белоголовая) до 4,66 (голштинская). Индекс Шенона находится в пределах 1,43–1,71. Индекс Fis имеет отрицательное значение и варьирует от минус 0,02 до минус 0,12. Уровень наблюдаемой гетерозиготности сопоставим с ожидаемой гетерозиготностью, избытка гетерозигот и инбридинга не выявлено. Отдельные кластеры образуют герефордская и казахская белоголовая порода, красно-пестрая голштинская и голштинская, галловейская и симментальская породы. Полученные результаты можно рассматривать в качестве базы сравнения в последующих поколениях, а также в оценке пород других регионов.

1. Айтназаров Р.Б., Мишакова Т.М., Юдин Н.С. Оценка генетического разнообразия и филогенетических отношений черно-пестрого скота Новосибирской области с использованием микросателлитных маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021. № 8 (25). С. 831-838. https://doi.org/10.18699/VJ21.096

2. Аржанкова Ю.В., Мосачихина И.А., Харитонов А.В. Генетические особенности черно-пестрого и помесного крупного рогатого скота по микросателлитным локусам // Известия Великолукской сельскохозяйственной академии. 2015. № 1. С 7-11. EDN: TNVQEV

3. Владимиров Л.Н., Мачахтырова В.А., Мачахтыров Г.Н. и др. Генетическое разнообразие популяции аборигенного якутского скота по микросателлитным локусам // Вестник НГАУ. 2024. № 2 (71). С. 199-208. https://doi.org/10.31677/2072-6724-2024-71-2-199-208

4. Глазко В.И. Геномная селекция крупного рогатого скота: исследовательские и прикладные задачи // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. 2011. № 5. С. 126-134. EDN: OIPTJJ

5. Глазко В.И., Косовский Г.Ю., Глазко Т.Т., Федорова Л.М. ДНК-маркеры и «Микросателлитный код» (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2023. № 2 (58). С. 223-248. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2023.2.223rus

6. Гладырь Е.А., Гончаренко Г.М., Горелов П.В. и др. Изучение изменчивости микросателлитов при создании нового типа мясного скота Сибири // Достижения науки и техники АПК. 2011. № 10. С. 30-32. EDN: OIYBHZ

7. Гладырь Е.А., Шадрина Я.Л., Горелов П.В. и др. Характеристика аллелофонда якутского скота по микросателлитам // Сельскохозяйственная биология. 2011. № 6. С. 65-69. EDN: ONLDRB

8. Гладырь Е.А., Зиновьева Н.А., Косян Д.Б. и др. Характеристика аллелофонда крупного рогатого скота некоторых мясных пород, разводимых на территории Южного Урала и Западной Сибири // Достижения науки и техники АПК. 2014. № 3. С. 61-64. EDN: PXWWXJ

9. Глинская Н.А. Анализ генетической дифференциации популяций крупного рогатого скота черно-пестрой породы белорусской селекции по STR- локусам // Вестник Полесского государственного университета. 2013. № 2. С 21-26

10. Николаев С.В., Ялуга В.Л. Сравнительная генетическая характеристика микросателлитного профиля голштинизированных и чистопородных холмогорских быков // Аграрная наука. 2023. № 7. С. 58-62. https://doi.org/10.32634/0869-8155-2023-372-7-58-62

11. Петров А.Ф., Камалдинов Е.В. Генетическая структура сибирского отродья по микросателлитным маркерам // Вестник НГАУ. 2024. № 3 (72). С. 230-239. https://doi.org/10.31677/2072-6724-2024-72-3-230-239

12. Прожерин В.П., Селькова И.В., Калашников А.Е. Генетическая изменчивость быков-производителей архангельской популяции холмогорской породы крупного рогатого скота по поколениям // Вестник РГАТУ. 2020. № 4 (48). С. 47-53. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2023.2.223rus

13. Слепцов И.И., Додохов В.В., Павлова Н.И., Каюмов Ф.Г. Полиморфизм 15 микросателлитных локусов ДНК у крупного рогатого скота калмыцкой породы и аборигенного якутского скота, разводимых на территории Республики Саха (Якутия) // Животноводство и кормопроизводство. 2019. № 2 (102). С. 60-67. https://doi.org/10.33284/2658-3135-102-2-60

14. Филиппова Н.П., Павлова Н.И., Корякина Л.П. и др. Микросателлитный анализ якутского скота // Животноводство и кормопроизводство. 2018. Т. 101, № 4. С. 58-63.

15. Часовщикова М.А. Генетическая характеристика голштинской породы крупного рогатого скота с использованием микросателлитных ДНК-маркеров // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2019. № 2 (76). С. 191-193. EDN: OESLHF

16. Часовщикова М.А. Генетическая характеристика черно-пестрой породы крупного рогатого скота с использованием микросателлитных маркеров // Вестник Бурятской государственной академии имени В.Р. Филиппова. 2021. № 1 (62). С. 64-69. https://doi.org/10.34655/bgsha.2021.62.1.009

17. Чесноков Ю.В., Артемьева А.М. Оценка меры информационного полиморфизма генетического // Сельскохозяйственная биология. 2015. Т 5, № 5. С. 571-578. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2015.5.571rus

18. Шевелёва О.М., Часовщикова М.А. Характеристика генетической структуры стада герефордской породы по STR-локусам // Животноводство и кормопроизводство. 2018. № 4 (101). С. 71-78

19. Шукюрова Е.Б., Лукашина А.А., Бузько А.Н. Генетическая характеристика голштинского крупного рогатого скота по ДНК-микросателлитам // Вестник Дальневосточного отделения Российской академии наук. 2020. № 4. С. 47-52. https://doi.org/10.37102/08697698.2020.212.4.008

20. Olsсhewsky A., Hinrichs D. An overview of the use of genotyping techniques for assessing genetic diversity in local farm animals breeds. Animal (Basel). 2021;11(7):2016. https://doi.org/10.3390/ani11072016