Блинова София Алексеевна, младший научный сотрудник ; научный сотрудник
127434, г. Москва, Тимирязевская ул., 42
тел.: (915) 125–87–13
Sofiya A. Blinova, Junior Research Associate, , Research Associate
42 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434
phone: (915) 125–87–13
Конышева Мария Леонидовна, научный сотрудник
127434, г. Москва, Тимирязевская ул., 42
тел.: (920) 627–04–90
Mariya L. Konysheva, Research Associate
42 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434,
phone: (920) 627–04–90
Шварцев Алексей Анатольевич, научный сотрудник ; аспирант
127434, г. Москва, Тимирязевская ул., 42 ;
127434, г. Москва, Тимирязевская ул., 49
тел.: (925) 161–15–63
Aleksey A. Shvartsev, Research Associate of LLC “Syntol”, post-graduate student
49 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434
phone: (925) 161–15–63
Соловьев Александр Александрович, д-р биол. наук, профессор РАН, заведующий лабораторией маркерной и геномной селекции растений
127434, г. Москва, Тимирязевская ул., 42
тел.: (926) 164–16–30
Aleksandr A. Solov’ev, DSc (Bio), RAS Professor, Head of the Laboratory of Marker and Genomic Plant Selection
42 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434
phone: (926) 164–16–30
Алексеев Яков Игоревич, канд. биол. наук, директор по науке
127434, г. Москва, Тимирязевская ул., 42
тел.: (916) 628–00–31
Yakov I. Alekseev, PhD (Bio), Scientific Director
42 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434
phone: (916) 628–00–31
Мазурин Евгений Сергеевич, канд. биол. наук, руководитель лабораторий тех. поддержки
115114, г. Москва, Летниковская ул., 2
тел.: (495) 933–77–55
Evgeniy S. Mazurin, PhD (Bio), Head of Technical Support Laboratories
2 Letnikovskaya Str., Moscow, 115114
phone: (495) 933–77–55
Грибы являются возбудителями множества болезней растений, наносящих значительный ущерб урожаю и приводящих к существенным экономическим потерям. Одними из самых широко распространенных и опасных патогенов являются грибы рода Sclerotinia. Представители данного рода способны поражать большинство важных сельскохозяйственных культур ввиду отсутствия у последних устойчивости, что впоследствии приводит к гибели растений. В связи с этим необходимо проводить диагностику растительного материала на наличие грибов данного рода. Целью исследований являлась апробация разработанных систем праймеров и зондов для выявления наиболее опасных представителей рода Sclerotinia – таких, как S. sclerotiorum, S. nivalis, S. borealis и S. Minor. Проверка проводилась как на заведомо положительных образцах культур грибов, так и на растениях с полей (в частности, озимой пшеницы – для проведения скринингового исследования и определения уровня зараженности S. borealis). Материалом для исследований послужили 24 образца грибов, относящихся к роду Sclerotinia, полученные из ООО «Сингента», и 37 образцов озимой пшеницы из разных мест возделывания. Определение видовой принадлежности культур грибов осуществлялось методом секвенирования по Сенгеру с использованием разработанных пар праймеров на участок гена β-tubulin (tub) и фрагмент кластера генов rRNA. Дополнительно были сконструированы олигонуклеотиды для проведения видовой дифференциации вида S. borealis методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ). При определении аналитических характеристик набора было показано отсутствие ложноположительных и ложноотрицательных результатов. Проведение скрининговых исследований 37 образцов озимой пшеницы показало наличие нуклеиновых кислот исследуемого патогена у 24,3% проанализированных образцов. При проведении исследования не было обнаружено сильно зараженных образцов, что говорит о нахождении патогена в начальной фазе его развития.
Phytopathogenic fungi are the causative agent for disruptive crop plant diseases, besides causing significant losses in crop yield annually. Sclerotinia is one of the most common and dangerous pathogens. Species of the Sclerotinia genus cause widespread disease across a broad range 40 of economically important agricultural crops. Regular screening of Sclerotinia in plant material is necessary due to wide host-plants range and absence of resistance to this phytopathogen. The purpose of this study was to test the developed systems of primers and probes to identify the most dangerous species of Sclerotinia genus, such as S. sclerotiorum, S. nivalis, S. borealis and S. minor. This system has been tested on positive samples of fungal cultures. Screening study and determination of the infection level with S. borealis were carried out on winter wheat. The material for the study was 24 samples of fungi belonging to the genus Sclerotinia obtained from Syngenta LLC and 37 winter wheat samples from different places of growth. Species identification of fungal cultures was carried out by Sanger sequencing using the developed pairs of primers for the β-tubulin (tub) gene region and a fragment of the rRNA gene cluster. Additionally, oligonucleotides were designed for the identification of S. borealis by real-time polymerase chain reaction (qPCR). In determining the analytical characteristics of the kit, the absence of false positive and false negative results was demonstrated. Screening studies of 37 winter wheat samples showed the presence of nucleic acids of the studied pathogen in 24.3% among the analyzed samples. There were no severely infected samples among the tested, which indicates that the pathogen is in the initial stage of its development.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.